Když byl před čtyřmi lety zničen Jurský park, neznamenalo to definitivní konec dinosaurů. Celou dobu totiž existoval druhý utajený ostrov Isla Sorna, na kterém byli dinosauři pěstováni "v divoké přírodě", bez ohrad a dohledu, a odkud byli převáženi na Isla Nublar. Nyní ale posádka výletní lodě nešťastnou náhodou druhý ostrov objevila a je nutno podniknout rozhodné kroky. Proto John Hammond (Richard Attenborough), duchovní otec původního parku, povolává Iana Malcolma (Jeff Goldblum) a žádá ho, aby vedl novou výpravu, jejímž úkolem bude zdokumentovat život dinosaurů na Isla Sorna (zdá se, že jeho jedinou kvalifikací pro tuto náročnou práci je fakt, že už se jednou s dinosaury setkal a přežil to). Navíc je shodou okolností na ostrově zoologická odbornice Sarah Hardingová (Julianne Moore), která byla Hammondem vyslána napřed a která má Malcolma částečně motivovat k účasti, protože byla jeho přítelkyní. Kromě toho s výpravou cestuje jako černý pasažér také Malcolmova dcerka.